Una Apea richiede una gestione unitaria dei servizi e delle infrastrutture d'area in essa presenti. Tale gestione è finalizzata a: offrire economie di scala alle aziende insediate nell'Apea, garantire alle stesse aziende supporto e assistenza in termini burocratici, tecnici e formativi, e a perseguire un continuo percorso di qualificazione urbanistica e ambientale attraverso il raggiungimento di elevati obiettivi di qualità.

Al Soggetto Gestore è affidata la gestione complessiva dell'Area Produttiva Ecologicamente Attrezzata, nonché la generale responsabilità in merito a:

• Analisi Ambientale: mira a fornire un quadro conoscitivo iniziale dell'ambito, e rilevare criticità ed esigenze degli insediati; nel caso di ambiti interessati dalla pianificazione e progettazione urbanistica di nuovi ampliamenti, l'Analisi Ambientale dovrà unicamente fornire le necessarie integrazioni agli elaborati e agli studi già richiesti alla progettazione degli ampliamenti;
• Programma Ambientale: in funzione dei risultati emersi dall'analisi, individua priorità e azioni volte a conseguire una gestione di qualità e un miglioramento continuo nel tempo;
• Monitoraggio delle attività previste per la corretta gestione ambientale dell'area.