La secentesca sacrestia della Collegiata ospita circa cinquanta dipinti della grande scuola bolognese del XV-XVIII secolo e oltre quaranta oggetti di uso liturgico datati a partire dal XIV secolo. Tra le opere di maggior pregio si segna la tavola del "San Giovanni Battista" del Francia, oltre ai dipinti di Alessandro Tiarini, Donato Creti ed Ercole Graziani. Fanno parte della collezione anche due ovali riproducenti San Filippo e San Giacomo, prime opere giovanili di Ubaldo Gandolfi.

La raccolta di oggetti liturgici è composta da argenterie che vanno dal XVI al XIX secolo, corali del XIV secolo con splendide miniature di Nicolò Di Giacomo e paramenti sacri.