È il più importante museo paleontologico italiano, con oltre 500.000 pezzi conservati. Il reperto più antico risale a 750 milioni di anni fa. Quattro le sezioni: le antiche collezioni, le piante fossili, i vertebrati fossili, le collezioni di rocce e invertebrati fossili. Fra gli esemplari più interessanti spicca un colossale scheletro di Diplodocus, dinosauro del Giurassico lungo 25 metri, unico in Italia. L'allestimento conserva l'impostazione ottocentesca con gli arredi d'epoca ed alcune preziose vetrine del '700.

La Collezione fa parte del Sistema Museale di Ateneo dell'Alma Mater Studiorum - Università di Bologna.

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