Molteplici esemplari di cristallizzazioni e minerali provenienti dall'area dei Gessi Bolognesi e da altre aree geografiche, affiancano alcuni strumenti utilizzati dagli speleologi bolognesi fin dal 1932, anno di fondazione del GSB, per opera di Luigi Fantini. Il Museo è stato completamente rinnovato nel dicembre 2018, potenziando la collezione di attrezzature speleologiche e informatizzando buona parte del patrimonio documentale, consultabile sul sito web, in stretta relazione con l’attività corrente. Al piano terra sono funzionanti piccoli spazi modulari, muniti di impianti tecnologici, per eventi e mostre. In funzione anche un laboratorio didattico rivolto ai bambini sui fenomeni carsici e storia della speleologia.