Gli ambienti monumentali dell'ex appartamento del Legato Pontificio ospitano opere d'arte dal XIII secolo ai primi del Novecento (Lippo di Dalmasio, Francesco Francia, Tintoretto, Ludovico Carracci, Artemisia Gentileschi, Cagnacci, Creti, Giuseppe Maria Crespi, Ubaldo e Gaetano Gandolfi, Palagi, Hayez). Inoltre mobili, miniature e testimonianze d'arte applicata, come i notevoli esempi della produzione di merletti e ricami Aemilia Ars.